????前不久,國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《自然-遺傳學(xué)》(Nature Genetics)以兩篇長(zhǎng)文形式在線發(fā)表了兩項(xiàng)由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院聯(lián)合國(guó)內(nèi)外單位開展的瓜類作物基因組研究成果。這兩項(xiàng)研究分別構(gòu)建了甜瓜和西瓜的全基因組變異圖譜,揭示了兩種水果的馴化歷史及果實(shí)品質(zhì)的遺傳分子機(jī)制。
????中國(guó)農(nóng)科院鄭州果樹研究所研究員徐永陽(yáng)說(shuō),其所在團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中國(guó)農(nóng)科院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所、西班牙巴塞羅那基因組中心及中國(guó)農(nóng)科院蔬菜花卉研究所、青島農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、美國(guó)康奈爾大學(xué)、法國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院等19個(gè)國(guó)內(nèi)外科研機(jī)構(gòu),歷時(shí)5年,共同構(gòu)建了世界第一個(gè)甜瓜全基因組變異圖譜,首次系統(tǒng)闡釋了甜瓜的復(fù)雜馴化歷史及重要農(nóng)藝性狀形成的遺傳基礎(chǔ)。甜瓜研究團(tuán)隊(duì)分析了千余份甜瓜種質(zhì)資源的基因組變異,共鑒定了560萬(wàn)個(gè)SNP。
????在此基礎(chǔ)上,科研團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)甜瓜可能發(fā)生過(guò)3次獨(dú)立的馴化事件,其中一次發(fā)生在非洲地區(qū),另外兩次發(fā)生在亞洲地區(qū)并分別產(chǎn)生了厚皮甜瓜和薄皮甜瓜兩個(gè)栽培亞種。3次獨(dú)立馴化“異曲同工”,都導(dǎo)致野生甜瓜失去了苦味和酸味并獲得了甜味。此外,通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析等手段,定位了200余個(gè)與甜瓜苦味、酸味、果實(shí)大小、果肉顏色等性狀相關(guān)的候選基因和位點(diǎn)。
????中國(guó)農(nóng)科院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員黃三文所在的團(tuán)隊(duì),則協(xié)同鄭州果樹研究所、北京市農(nóng)林科學(xué)院、美國(guó)康奈爾大學(xué)組成聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊(duì),采用單分子測(cè)序、光學(xué)圖譜與Hi-C三維基因組聯(lián)合分析,完成了高質(zhì)量的西瓜基因組序列圖譜。繼而對(duì)400多份種質(zhì)資源開展了基因組變異分析,共鑒定近2000萬(wàn)個(gè)SNP。
????在此基礎(chǔ)上,科研團(tuán)隊(duì)首次明確了西瓜7個(gè)種之間的進(jìn)化關(guān)系,發(fā)現(xiàn)野生黏籽西瓜是距現(xiàn)代栽培西瓜親緣關(guān)系最近的種群,也發(fā)現(xiàn)了利用野生西瓜進(jìn)行抗性改良的基因組痕跡。此外,鑒定獲得了與果實(shí)含糖量、瓤色、形狀等性狀關(guān)聯(lián)的43個(gè)信號(hào)位點(diǎn),提供了關(guān)鍵候選基因。
????來(lái)自中國(guó)農(nóng)科院的消息稱,這兩項(xiàng)成果為西甜瓜種質(zhì)資源研究提供新的理論框架和組學(xué)數(shù)據(jù),也為西甜瓜分子育種提供了大量的基因資源和選擇工具,具有重要科學(xué)價(jià)值和實(shí)踐意義。相關(guān)成果的發(fā)表將進(jìn)一步強(qiáng)化我國(guó)在瓜類作物基因組學(xué)與分子育種領(lǐng)域的國(guó)際領(lǐng)先地位。