因為豐富的色彩和形態(tài)等多樣性,蝴蝶長期以來是昆蟲生態(tài)與進化研究的重要主題。近日,中國科學院昆明動物研究所進化基因組學與基因起源學科組在蝴蝶顏色進化方面的研究取得新進展,為了解鳳蝶色素的起源提供了新見解,同時為探索蝴蝶的進化、生態(tài)學和保護提供了重要的理論基礎(chǔ)。相關(guān)結(jié)果在線發(fā)表在英文期刊《動物學研究》上。
蝴蝶是鳳蝶總科的物種統(tǒng)稱,因其形態(tài)多樣性,自達爾文時代就是研究物種適應性進化的重要類群之一。近年來,它更被認為是研究形態(tài)遺傳、進化和發(fā)育的理想模型,已成為發(fā)育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態(tài)學等研究領(lǐng)域的重要模式生物之一。特別是鳳蝶含有一類獨特的鳳蝶色素,有助其翅膀顏色多樣性的形成,以及如躲避捕食者和擇偶等各種生物學功能的發(fā)揮,因此其同時也是探討動物復雜性狀起源和重塑的理想模型。
2015年,該學科組解析了金鳳蝶及其近緣種柑橘鳳蝶基因組,并以蝴蝶為例首次實現(xiàn)野生昆蟲的基因編輯。為進一步探討蝴蝶形態(tài)等表型多樣性進化的遺傳基礎(chǔ),2017年蝴蝶譜系基因組計劃啟動。作為先期研究,該學科組利用最新技術(shù),解析了廣泛分布在東亞、南亞以及東南亞,并對體色進化及物種分化具有重要研究意義的碧鳳蝶的染色體水平的基因組、經(jīng)典偽裝物種枯葉蛺蝶染色體水平的高質(zhì)量基因組。
近期,研究團隊利用三代長讀長測序技術(shù)又解析了包括鳳蝶科的鳳蝶亞科和絹蝶亞科的所有族的代表種類共11種鳳蝶的高質(zhì)量參考基因組,構(gòu)建了族水平穩(wěn)定的系統(tǒng)發(fā)育樹。研究結(jié)果提示,位于模式基因和效應基因上游調(diào)控區(qū)的鳳蝶科特異的非編碼保守元件和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的進化,以及效應基因的快速進化,可能促進了鳳蝶色素的起源與進化。